Prof. Dr. Dr. Fabian J. Theis
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Wissenschaftliche Laufbahn und Forschungsgebiete
Prof. Theis (*1976) forscht auf dem Gebiet der Systembiologie. Schwerpunkt ist die mathematische Modellierung biologischer Prozesse - im Vordergrund stehen die Modellierung von Zellheterogenitäten durch Einzelzellanalysen und die Integration von omics-Daten in systemmedizinischen Ansätzen.
Nach dem Studium der Mathematik und Physik promovierte Fabian Theis in der Biophysik an der Uni Regensburg (2002), wo er 2008 auch habilitierte. Parallel promovierte er in Informatik an der Uni Granada (2003). Nachdem er als Postdoc in Regensburg, Tokyo und Tallahassee arbeitete, war er von 2006 bis 2007 Bernstein Fellow am MPI für Dynamik und Selbstorganisation in Göttingen. Anschließend leitete er sechs Jahre lang die Arbeitsgruppe für ‚Computational Modeling in Biology’ am Helmholtz Zentrum München und wurde 2009 „Associate Professor“ am Lehrstuhl für Angewandte Mathematik der TUM. Seit 2013 ist Prof. Theis Ordinarius für Biomathematik an der TUM und leitet das Institute of Computational Biology am Helmholtz Zentrum München.
Wichtigste Auszeichnungen
- Gottfried Wilhelm Leibniz Preis (2023)
- Hamburger Wissenschaftspreis (2021)
- Erwin-Schrödinger-Preis (2017)
- ERC-Starting Grant (2010) und ERC Advanced Grant (2022)
- Heinz Maier-Leibnitz Preis, DFG (2006)
Schlüsselpublikationen
Klein, D., Palla, G., Lange, M., Klein, M., Piran, Z., Gander, M., Meng-Papaxanthos, L., Sterr, M., Saber, L., Jing, C., Bastidas-Ponce, A., Cota, P., Tarquis-Medina, M., Parikh, S., Gold, I., Lickert°, H., Bakhti, M., Nitzan, M., Cuturi, M., Theis°, F.J. “Mapping cells through time and space with moscot”. Nature. 2025; 638, 1065–1075.
° joint corresponding authors
Sikkema, L., Ramírez-Suástegui, C., Strobl, D.C., Gillett, T.E., Zappia, L., Madissoon, E., Markov, N.S., Zaragosi, L.-E., Ji, Y., Ansari, M., Arguel, M.-J., Apperloo, L., Banchero, M., Bécavin, C., Berg, M., Chichelnitskiy, E., Chung, M-i., Collin, A., CA Gay, A., Gote-Schniering, J., Kashani, B.H., Inecik, K., Jain, M., Kapellos, T.S., Kole, T.M., Leroy, S., Mayr, C.H., Oliver, A.J., von Papen, M., Peter, L., Taylor, C.J., Walzthoeni, T., Xu, C., Bui, L.T., De Donno, C., Dony, L., Faiz, A., Guo, M., Gutierrez, A.J., Heumos, L., Huang, N., Ibarra, I.L., Jackson, N.D., Murthy, P.K.L., Lotfollahi, M., Tabib, T., Talavera-López, C., Travaglini, K.J., Wilbrey-Clark, A., Worlock, K.B., Yoshida, M., Lung Biological Network Consortium, van den Berge, M., Bossé, Y., Desai, T.J., Eickelberg, O., Kaminski, N., Krasnow, M.A., Lafyatis, R., Nikolic, M.Z., Powell, J.E., Rajagopal, J., Rojas, M., Rozenblatt-Rosen, O., Seibold, M.A., Sheppard, D., Shepherd, D.P., Sin, D.D., Timens, W., Tsankov, A.M., Whitsett, J., Xu, Y., Banovich, N.E., Barbry, P., Duong, T.E., Falk, C.S., Meyer, K.B., Kropski, J.A., Pe’er, D., Schiller, H.B., Tata, P.R., Schultze, J.L., Teichmann, S.A., Misharin, A.V., Nawijn, M.C., Luecken, M.D.°, Theis, F.J.° “An integrated cell atlas of the lung in health and disease”. Nature Medicine. 2023; 29(6), 1563–1577.
° joint corresponding authors
Lange, M., Bergen, V., Klein, M., Setty, M., Reuter, B., Bakhti, M, Lickert, H. Ansari, M. Schniering, J. Schuller, H.B., Pe´er D.°, Theis F.J.° “CellRank for directed single-cell fate mapping”. Nature Methods. 2022; 19, 159–170.
° joint corresponding authors
Bergen, V., Lange, M., Peidli, S., Wolf, F. A.°, & Theis, F. J.° “Generalizing RNA velocity to transient cell states through dynamical modeling”. Nature Biotechnology. 2020; 38(12), 1408-1414.
° joint corresponding authors
Lotfollahi, M., Wolf, F.A.°, Theis, F.J.° “scGen predicts single-cell perturbation responses.” Nature Methods. 2019; 16, 715-721.
° joint corresponding authors
Bei Änderungs- oder Aktualisierungswünschen wenden Sie sich bitte an Franz Langer.