Prof. Dr. Frank Johannes
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Wissenschaftliche Laufbahn und Forschungsgebiete
Die Forschung von Prof. Johannes (*1976) befasst sich mit dem Gebiet der Pflanzenepigenomik. Seine Forschungsgruppe verbindet bioinformatische und statistische genetische Ansätze mit Hochdurchsatz-Molekularen-Daten zur Charakterisierung epigenetischer Variationsmuster in Pflanzenpopulationen. Dabei erforscht er, wie diese Variation entsteht, wie stabil sie über mehrere Generationen ist und in welchem Maß sie landwirtschaftlich und evolutionär relevante Pflanzenmerkmale beeinflusst. Ein langfristiges Ziel dieser Arbeit ist die Nutzung synthetisch oder natürlich vorkommender Epimutationen zur Verbesserung der Nutzpflanzen.
Prof. Johannes promovierte an der Pennsylvania State University (USA) mit dem Schwerpunkt statistische Genetik. Im letzten Jahr seiner Promotion arbeitete er als Marie Curie Stipendiat am französischen Nationalen Institut für Agrarforschung (INRA), wo er an einer der ersten epigenetischen Studien über Pflanzen auf Populationsebene beteiligt war. Anschließend war er Postdoc am französischen Nationalen Zentrum für wissenschaftliche Forschung (CNRS) und später in der Bioinformatik Forschungsgruppe der Universität Groningen (NL). Er blieb in Groningen als Assistant Professor bis er als Rudolf Mößbauer Professor an das TUM-IAS berufen wurde.
Schlüsselpublikationen (alle Publikationen)
Hofmeister BT, Denkena J, Colomé-Tatché M, Shahryary Dizaji Y, Hazarika RR, Grimwood J, Mamid S, Jenkins J, Grabowski PP, Sreedasyam A, Shu A, Barry K, Lail K, Adam C, Lipzen A, Sorek R, Kudrna D, Talag J, Wing R, Hall DW, Jacobsen D, Tuskan GA, Schmutz J, Johannes F*, Schmitz RJ*: “A genome assembly and the somatic genetic and epigenetic mutation rate in a wild long-lived perennial Populus trichocarpa”. Genome Biology. 2020.
AbstractLauss K, Wardenaar R, Oka R, H. A. van Hulten M, Guryev V, J. B. Keurentjes J, Stam M, Johannes F: “Parental DNA Methylation States Are Associated with Heterosis in Epigenetic Hybrids”. Plant Physiology. 2018; 176(2): 1627–1645.
Abstractvan der Graaf A, Wardenaar R, Neumann DA, Taudt A, Shaw RG, Jansen RC, Schmitz RJ, Colomé-Tatché M, Johannes F: “Rate, spectrum and evolutionary dynamics of spontaneous epimutations”. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2015; 112(21): 6676-81.
AbstractCortijo S, Wardenaar R, Colomé-Tatché M, Gilly A, Etcheverry M, Labadie K, Caillieux E, Hospital F, Aury J-M, Wincker P, Roudier F, Jansen RC, Colot V, Johannes F: “Mapping the epigenetic basis of complex traits”. Science. 2014; 343(6175): 1145-8.
AbstractJohannes F, Porcher E, Teixeira F, Saliba-Colombani V, Simon M, Agier N, Bulski A, Albuisson J, Heredia F, Bouchez D, Dillmann C, Guerche P, Hospital F, Colot V: “Assessing the impact of transgenerational epigenetic variation on complex traits”. PLoS Genetics. 2009; 5(6): e1000530.
Abstract