Prof. Dr. Markus List
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Wissenschaftliche Laufbahn und Forschungsgebiete
Prof. Lists (*1984) Forschungsgebiet ist Data Science in Systems Biology. Diese interdiszipinäre Brückenwissenschaft verbindet die Biologie, Medizin und (Bio)-Informatik mit dem zunehmend wichtigeren Feld der Data Science. In der Systembiologie ist das Ziel genregulatorische Mechanismen im zellulären System über verschiedene Molekularebenen (v.a. Genom, Transkriptom und Epigenom) hinweg zu verstehen. Zur Nutzbarmachung und Interpretation dieser Daten nutzt die Gruppe moderne Ansätze des maschinellen Lernens und der Datenintegration.
Prof. List studierte Bioinformatik an der Eberhard-Karls-Universität Tübingen inklusive eines DAAD-geförderten Aufenthaltes an der University of Auckland (Neuseeland). Im Anschluss promovierte er an der Universität Süd-Dänemark im Bereich der Krebsforschung, gefolgt von einem Postdoc im Bereich Epigenetik am Max-Planck-Institut für Informatik. Ab 2018 forschte Prof. List mit seiner Gruppe Big Data in Biomedicine an der School of Life Sciences der TUM. Dort wurde Prof. List Ende 2023 auf die Professur für Data Science in Systems Biology berufen.
Wichtigste Auszeichnungen
- Forschungspreis der Hamburger Krebsgesellschaft e.V. (2023)
- TUM Lehrpreis der Fachschaft Bioinformatik (2023)
- TUM School of Life Sciences Graduate Council Supervisory Award (2022)
- Best Poster Award der Advances in Microarray Technology Konferenz (2014)
- Stipendium des Deutschen Akademischen Auslandsdienstes (2010)
Schlüsselpublikationen (alle Publikationen)
Hartung, M., Anastasi, E., Mamdouh, Z. M., Nogales, C., Schmidt, H. H., Baumbach, J., ... & List, M. Cancer driver drug interaction explorer. Nucleic Acids Research (2022). Volume 50, Issue W1, 5, Pages W138–W144.
AbstractLouadi, Z., Elkjaer, M. L., Klug, M., Lio, C. T., Fenn, A., Illes, Z., Bongiovanni, D., Baumbach, J., Kacprowski, T., Tsoy, O. & List, M., Functional enrichment of alternative splicing events with NEASE reveals insights into tissue identity and diseases. Genome Biol (2021), 22, 327.
AbstractLazareva, O., Baumbach, J., Blumenthal, D.B., List, M., On the limits of active module identification, Briefings in Bioinformatics (2021), bbab066.
AbstractLouadi, Z., Yuan, K., Gress, A., Tsoy, O., Kalinina, O.V., Baumbach, J., Kacprowski, T., List, M. DIGGER: exploring the functional role of alternative splicing in protein interactions, Nucleic Acids Research (2020), gkaa768.
AbstractSturm, G., Finotello, F., Petitprez, F., Zhang, J. D., Baumbach, J., Fridman, W. H., Aneichyk, T. & List M. (2019). Comprehensive evaluation of computational cell-type quantification methods for immuno-oncology. Bioinformatics (2019).
Abstract