Prof. Dr. Melanie Schirmer
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Wissenschaftliche Laufbahn und Forschungsgebiete
Melanie Schirmer studierte Mathematik an der Universität Bonn. Sie promovierte 2014 an der University of Glasgow (Schottland), wo sie sich mit der Analyse von Next-Generation-Sequenzierungsdaten beschäftigte, um biologische Variation (d. h. Einzelnukleotid-Polymorphismen) von Fehlern und Verzerrungen zu unterscheiden.
Im Jahr 2015 begann sie ihre Postdoc-Zeit am Broad Institute des MIT und der Harvard & Harvard T.H. Chan School of Public Health (USA) und wurde 2018 Computerwissenschaftlerin am Broad Institute. Ihre Forschung dort konzentrierte sich auf das menschliche Mikrobiom und die Identifizierung von mikrobiellen Faktoren, die an der Pathogenese von entzündlichen Darmerkrankungen und Immunreaktionen beteiligt sind. Im Jahr 2020 kehrte sie nach Deutschland zurück, um ihre eigene unabhängige Forschungsgruppe an der Technischen Universität München (TUM) zu gründen, die mit einem Emmy Noether-Preis (2020) und einem ERC Starting Grant (2022) gefördert wurde. Seit 2023 ist sie Rudolf-Mößbauer-Tenure-Track-Professorin für Translationale Mikrobiom-Datenintegration an der TUM.
Wichtigste Auszeichnungen
- Highly cited researcher (Clarivate) (2021,2022,2023)
- ERC Starting Grant (2022)
- Life Sciences Bridge Award (Aventis Foundation) (2022)
- Emmy-Noether Award (Deutsche Forschungsgemeinschaft) (2020)
- Career Development Award (Crohn's and Colitis Foundation) (2018)
Schlüsselpublikationen (alle Publikationen)
M. Schirmer, M. Stražar, J. Avila-Pacheco, D. F. Rojas-Tapias, E. M. Brown, ..., R. J. Xavier, Linking microbial genes to plasma and stool metabolites uncovers host-microbial interactions underlying ulcerative colitis disease course, [Cell Host & Microbe, 2024].
AbstractD.F. Rojas-Tapias, E.M. Brown, E.R. Temple, M. Onyekaba, A.M.T. Mohamed, K. Duncan, M. Schirmer, …., R.J. Xavier, Inflammation-associated nitrate facilitates ectopic colonization of an oral microbe in the intestine, [Nature Microbiology, 2022].
AbstractS. Jin, D. Wetzel, M. Schirmer, Deciphering mechanisms and implications of bacterial translocation in human health and disease [Current Opinion in Microbiology, 2022].
AbstractJ. Lloyd-Price, C. Arze, A.N. Ananthakrishnan, M. Schirmer, J. Avila-Pacheco, ..., C. Huttenhower, Multi-omics of the Gut Microbial Ecosystem in Inflammatory Bowel Disease [Nature, 2019].
AbstractM. Schirmer, L. Denson, H. Vlamakis, E.A. Franzosa, S.M. Thomas, ..., R.J. Xavier, Compositional and temporal changes in the gut microbiome of pediatric ulcerative colitis patients are linked to disease course [Cell Host & Microbe, 2018].
Abstract